Pri Downovom syndróme bolo spísaných viac než 120 charakteristických znakov, no mnoho detí s týmto syndrómom ich nemá viac ako 6 - 8.
Medzi najfrekventovanejšie znaky Downovho syndrómu patria:
- šikmé očné štrbiny
- nadbytočná krčná kožná riasa
- hyperflexibilita kĺbov
- plochý vzhľad tváre
- hypotónia
- neprítomnosť Morovho reflexu
- prehnuté ušnice
- zbrázdený jazyk
- vysoké podnebie
- priečna ryha dlane a tzv. „sandálová“ medzeru medzi palcom a ukazovákom
K ďalším charakteristickým znakom sa najčastejšie zaraďuje epikantálna riasa v dôsledku ktorej oči pôsobia šikmo. Viacerí autori spomínajú Brushfieldové škvrny, teda biele, či mierne žlté bodky na okraji dúhovky. Epikantálna riasa a Brushfieldové škvrny nebránia videniu a časom sa môžu úplne stratiť.
Za zmienku stojí aj plochší nos s pomerne širokým koreňom. Ďalšou „odlišnosťou“ je komunikácia detí s Downovým syndrómom. Časté rozdiely vo svaloch a v ich štruktúre v oblasti tváre môžu viesť k ťažkostiam reči.